Преподаватели факультета ведут активную научную деятельность по направлениям связанным с совершенствованием средств и методов организованных форм физического воспитания дошкольников, учащейся молодежи и взрослого населения, занимаются вопросами оптимизации системы спортивной подготовки в различных видах спорта, изучают особенности различных функциональных систем у молодых людей, подвергшихся хроническому низкоинтенсивному радиоактивному облучению, а также исследуют возрастные изменения функционального состояния висцеральных систем организма детей со сколиозом, занимающихся лечебной физкультурой.
Факультет поддерживает научные связи с вузами России: Балтийским федеральным университетом имени Иммануила Канта (г.Калининград), Российским университетом спорта "ГЦОЛИФК" (г.Москва), Красноярским государственным педагогическим университетом имени В.П.Астафьева (г.Красноярск), Южным федеральным университетом (г.Ростов-на-Дону) и другими. На факультете проводятся научно-практические конференции международного, республиканского и регионального уровня, ежегодные межвузовские студенческие конференции. Преподавателями факультета ежегодно публикуется около 200 научных работ, в том числе в разные годы: учебники, учебные пособия, монографии, учебно-методические пособия, рекомендации, методические указания, статьи и др. Около 35% студентов дневной формы обучения факультета ежегодно участвуют во всех формах НИРС, выступают с докладами и публикуются в материалах международных конгрессов, республиканских, региональных, межвузовских, вузовских, факультетских научно-практических и методических конференций, выставках научных работ. Ежегодно лучшие конкурсные работы студентов становятся лауреатами республиканских конкурсов научных работ. На факультете организовано 18 студенческих научно-исследовательских групп, функционирует студенческая научно-исследовательская лаборатория «Победа».
